Adrián Segura Ortiz

Portafolio académico

Adrián Segura Ortiz

Investigador en inteligencia artificial y bioinformática centrado en métodos computacionales guiados por contexto para el análisis de datos biomédicos.

Puesto actual Associate Team Coordinator

Khaos Research · 2025-12 - Actualidad

Resumen

Resumen del portafolio

Soy investigador en inteligencia artificial aplicada a bioinformática, con una base sólida en informática y trabajo en la intersección de métodos computacionales, análisis de datos biomédicos, computación evolutiva y software científico reproducible.

Mi formación académica comprende Bachelor's Degree in Health Engineering with a specialization in Bioinformatics por Universidad de Málaga; Master's degree in Software Engineering and Artificial Intelligence por Universidad de Málaga; y Ph.D. in Computer Science por Universidad de Málaga. Mi experiencia profesional abarca 5 años y 7 meses en Universidad de Málaga, complementada con estancias de investigación de 2 meses en Kiyono Lab, perteneciente a GSES, perteneciente a The University of Osaka, ubicado en Toyonaka, Japan; 1 mes en INAB, perteneciente a Centre for Research and Technology Hellas, ubicado en Thermi, Greece; 1 mes en ORKAD, perteneciente a CRIStAL, perteneciente a Université de Lille, ubicado en Lille, France; 3 meses en Athena Research and Innovation Center in Information, Communication and Knowledge Technologies, ubicado en Athens, Greece; y 3 meses en ORKAD, perteneciente a CRIStAL, perteneciente a Université de Lille, ubicado en Lille, France, para un total de 10 meses en el extranjero. Entre nombramientos profesionales y estancias de investigación, este portafolio recoge trabajo directo en 5 instituciones.

Mi producción investigadora incluye 6 artículos de revista y 1 artículo de congreso, incluyendo 2 artículos en colaboración internacional y 1 artículo en colaboración nacional. En proyectos de investigación financiados, he participado como miembro del equipo de trabajo en 4 proyectos de investigación y he revisado 15 manuscritos enviados a revistas científicas.

El portafolio de software incluye 16 proyectos software y 4 paquetes publicados. La actividad pública de software abarca 15 repositorios, con 64 estrellas y 3 forks. El uso de paquetes suma 21.100 descargas.

Mi actividad docente incluye 4 cursos académicos en Universidad de Málaga, alcanzando 180 horas en 4 cursos académicos, 8 cursos y 4 titulaciones. Esta actividad docente comenzó en el curso 2022/2023 en la Universidad de Málaga, siendo en ese momento el docente más joven en incorporarse a labores docentes en el Departamento de Lenguajes y Ciencias de la Computación, algo que sería reconocido en 2026 en una carta de recomendación firmada por el director de la ETSII de la UMA. Esta actividad docente también incluye 1 proyecto de innovación docente. La supervisión académica incluye 1 trabajo fin de grado y 1 práctica externa.

La actividad de divulgación científica incluye 2 artículos de divulgación científica, 2 presentaciones, 27 noticias de prensa, 17 acciones en redes sociales y 1 acción en televisión en medios, canales institucionales y formatos dirigidos al público. La cobertura en prensa abarca 14 medios. Las acciones en redes sociales con métricas disponibles acumulan 68.300 visualizaciones; la acción más vista alcanza 38.700 visualizaciones.

Esta trayectoria académica también ha sido reconocida con 4 reconocimientos: Master's End-of-Program Extraordinary Award Profesor José María Troya Linero; Bachelor's End-of-Program Extraordinary Award Profesor José María Troya Linero; Destacad@s Awards 2021; y Award for the Best High School Academic Record, y apoyada mediante 6 ayudas: D2 research stay grant, vinculada a Investigador postdoctoral (estancia internacional) en The University of Osaka; IMMUNO-model COST Action STSM grant, vinculada a Investigador postdoctoral (estancia internacional) en Centre for Research and Technology Hellas; ROAR-NET COST Action mobility grant, vinculada a Investigador postdoctoral (estancia internacional) en Université de Lille; FPU mobility grant, vinculada a Investigador postdoctoral (estancia internacional) en Athena Research and Innovation Center in Information, Communication and Knowledge Technologies; FPU mobility grant, vinculada a Investigador predoctoral (estancia internacional) en Université de Lille; y Predoctoral grant (FPU), vinculada a PhD candidate - FPU Fellowship en Universidad de Málaga y Postdoctoral researcher - FPU-POP Fellowship en Universidad de Málaga.

Colaboraciones

Huella investigadora y colaboraciones en publicaciones

Ciudad de publicación Estancia de investigación Contrato de investigación

Producción investigadora

Publicaciones

Producción

Publicaciones por año

Artículo de revista Artículo de congreso

Software científico abierto

Software

Proyectos software

Código fuente

Lenguajes

Python 53.3%
Java 16.2%
MATLAB 10.4%
JavaScript 4.5%
R 3.9%
Shell 2.3%
CSS 2.2%
Other 7.3%

Paquetes software

Trayectoria

Trayectoria académica

Formación Experiencia Estancia de investigación Certificación Reconocimiento Bloque vinculado a ayuda

registros

Detalle de trayectoria

Estancia de investigación

Kiyono Lab

2026-10 - 2026-11 · Toyonaka, Japan

Investigador postdoctoral (estancia internacional)

Estancia de investigación

Investigador postdoctoral (estancia internacional)

2026-10 - 2026-11

Estancia internacional postdoctoral en Kiyono Lab, Graduate School of Engineering Science, The University of Osaka.

  • Ubicación: Toyonaka, Japan
  • Grupo anfitrión: Kiyono Lab, Biophysics and Data Science Group
  • Finalidad: Investigación postdoctoral, Estancia internacional
  • Ayudas: D2 research stay grant
Pública

D2 research stay grant

2026-07 · Universidad de Málaga

Movilidad postdoctoral

Referencia: D2 - II Plan Propio 2026

2026-10 - 2026-11

Registrada como ayuda concedida para una estancia de investigación en Kiyono Lab, The University of Osaka.

Estancia de investigación

INAB|CERTH

2026-09 - 2026-09 · Thermi, Greece

Investigador postdoctoral (estancia internacional)

Estancia de investigación

Investigador postdoctoral (estancia internacional)

2026-09 - 2026-09

Estancia internacional postdoctoral en el Institute of Applied Biosciences de CERTH.

  • Ubicación: Thermi, Greece
  • Grupo anfitrión: Institute of Applied Biosciences, CERTH
  • Finalidad: Investigación postdoctoral, Estancia internacional
  • Ayudas: IMMUNO-model COST Action STSM grant
Red internacional

IMMUNO-model COST Action STSM grant

COST Action CA21135 - Modelling immunotherapy response and toxicity in cancer (IMMUNO-model)

Movilidad postdoctoral

Referencia: E-COST-GRANT-CA21135-93b78129

2026-09 - 2026-09

Estancia de investigación

ORKAD

2024-04 - 2026-07 · Lille, France

Investigador postdoctoral (estancia internacional) <- Investigador predoctoral (estancia internacional)

Estancia de investigación

Investigador postdoctoral (estancia internacional)

2026-07 - 2026-07

Estancia internacional postdoctoral en el centro CRIStAL de la Universidad de Lille centrada en biclustering evolutivo quality-diversity y experimentación reproducible para datos heterogéneos.

  • Ubicación: Lille, France
  • Grupo anfitrión: Grupo de investigación ORKAD, centro CRIStAL
  • Finalidad: Investigación postdoctoral, Estancia internacional
  • Ayudas: ROAR-NET COST Action mobility grant
  • Desarrollé SALVI, un framework Python para biclustering quality-diversity de datos heterogéneos con preparación explícita de datos, inferencia de patrones, evaluación de objetivos, búsqueda tipo MOME, selección final y protocolos reproducibles de experimentación científica.
Estancia de investigación

Investigador predoctoral (estancia internacional)

2024-04 - 2024-06

Estancia internacional predoctoral en el centro CRIStAL de la Universidad de Lille.

  • Ubicación: Lille, France
  • Grupo anfitrión: Grupo de investigación ORKAD, centro CRIStAL
  • Finalidad: Doctorado, Estancia internacional
  • Ayudas: FPU mobility grant
  • Diseñé un framework de biclustering evolutivo especializado en datos biomédicos y guiado por contexto de dominio.
Red internacional

ROAR-NET COST Action mobility grant

2026-07 · COST Action CA22137 - Randomised Optimisation Algorithms Research Network (ROAR-NET)

Movilidad postdoctoral

Referencia: E-COST-GRANT-CA22137-a111cd9a

2026-07 - 2026-07

Estancia de investigación

Athena Research Center

2026-04 - 2026-06 · Athens, Greece

Investigador postdoctoral (estancia internacional)

Estancia de investigación

Investigador postdoctoral (estancia internacional)

2026-04 - 2026-06

Estancia internacional postdoctoral en Athena Research Center centrada en flujos reproducibles de benchmarking para descubrimiento y evaluación de redes de regulación génica.

  • Ubicación: Athens, Greece
  • Finalidad: Investigación postdoctoral, Estancia internacional
  • Ayudas: FPU mobility grant
  • Desarrollé ANDREA, una plataforma guiada por catálogos para la generación de datasets benchmark de expresión, inferencia de redes de regulación génica, evaluación y comparación de redes entre herramientas.
Pública

FPU mobility grant

Ministerio de Ciencia e Innovación. Universidades

Movilidad postdoctoral

Referencia: FPUES21/00006

2026-04 - 2026-06

Experiencia

Universidad de Málaga

2022-12 - Actualidad · Málaga, Andalusia, Spain

Postdoctoral researcher - FPU-POP Fellowship <- PhD candidate - FPU Fellowship

experiencia actual

Postdoctoral researcher - FPU-POP Fellowship

2025-12 - Actualidad

  • Ubicación: Málaga, Andalusia, Spain
  • Tipo: Tiempo completo, Presencial
  • Departamento: Lenguajes y Ciencias de la Computación (LCC)
Experiencia

PhD candidate - FPU Fellowship

2022-12 - 2025-12

  • Ubicación: Málaga, Andalusia, Spain
  • Tipo: Tiempo completo, Presencial
  • Departamento: Lenguajes y Ciencias de la Computación (LCC)
Tareas (7)
  • Diseñé algoritmos evolutivos y métodos híbridos de inteligencia artificial para problemas de bioinformática.
  • Integré más de 25 técnicas de inferencia de redes de regulación génica en entornos Docker reproducibles y paquetes PyPI.
  • Desarrollé algoritmos evolutivos asíncronos y paralelos para consenso de redes informado biológicamente.
  • Implementé algoritmos de biclustering multiobjetivo para datos clínicos y genómicos.
  • Publiqué resultados en revistas revisadas por pares y presenté trabajos en congresos con activos abiertos de reproducibilidad.
  • Impartí 8 asignaturas de grado en 4 titulaciones durante 4 cursos académicos.
  • Supervisé 1 trabajo fin de grado y 1 práctica externa.
Experiencia

Khaos Research

2021-07 - Actualidad · Málaga, Andalusia, Spain

Associate Team Coordinator <- Associate Software Engineer <- Junior Software Engineer

experiencia actual

Associate Team Coordinator

2025-12 - Actualidad

  • Ubicación: Málaga, Andalusia, Spain
  • Tipo: Tiempo parcial, Presencial
  • Grupo: Khaos Research
Experiencia

Associate Software Engineer

2022-12 - 2025-12

  • Ubicación: Málaga, Andalusia, Spain
  • Tipo: Tiempo parcial, Presencial
  • Grupo: Khaos Research
Tareas (5)
  • Desarrollé una herramienta de orquestación de flujos de trabajo en Go con almacenamiento SQLite, definiciones de componentes en JSON/YAML y soporte de ejecución en Kubernetes y Nomad.
  • Administré recursos computacionales con Proxmox y vSphere para despliegue, mantenimiento y monitorización de máquinas virtuales.
  • Procesé imágenes satelitales multifuente de Sentinel-2, PlanetScope y Landsat, incluyendo automatización de descargas, compuestos temporales, índices espectrales y manipulación de bandas.
  • Desarrollé interfaces Gradio para ejecución de modelos de teledetección y visualización de resultados.
  • Mantuve instalaciones, actualizaciones, despliegues y flujos de gestión de proyectos en OpenProject.
Experiencia

Junior Software Engineer

2021-07 - 2022-12

  • Ubicación: Málaga, Andalusia, Spain
  • Tipo: Tiempo completo, Presencial
  • Grupo: Khaos Research
Tareas (5)
  • Desarrollé aplicaciones web progresivas con Next.js y MongoDB para registro y análisis de muestras agrícolas.
  • Encapsulé scripts en Python, Java y R en contenedores Docker para componentes de EnBiC2-Lab.
  • Desarrollé un algoritmo evolutivo con JMetal y simulaciones EPANET para predecir propiedades de conectores de riego.
  • Contribuí a interfaces Angular para ejecución de flujos de trabajo científicos.
  • Gestioné tareas y coordinación de proyectos mediante OpenProject.
PhD

Ph.D. in Computer Science

Universidad de Málaga · 2022-10 - 2025-12

Outstanding (Cum Laude) with International Mention

Ayudas: Predoctoral grant (FPU)

Doctoral thesis: Context-Guided Computational Methods for the Consensus Inference of Gene Regulatory Networks and the Detection of Co-expression Patterns

Context-guided computational methods for biomedical data analysis

Certificación

Jornadas de Formación, Mejora e Investigación Docente

Universidad de Málaga · 2025-07

  • 10 horas
  • Teacher training and educational innovation course.
Certificación

IMFAHE International Mentor Program Student Certificate (2024-2025)

IMFAHE · 2025-06

Pública

FPU mobility grant

2024-03 · Ministerio de Ciencia e Innovación. Universidades

Movilidad postdoctoral

Referencia: EST24/00186

2024-06

Certificación

Introduction to the Use of Generative Artificial Intelligence in University Teaching

Universidad de Málaga · 2023-10

  • 12 horas
  • University teaching certification.
Reconocimiento

Master's End-of-Program Extraordinary Award Profesor José María Troya Linero

2023-07 · Universidad de Málaga

Premio al mejor expediente académico del Máster en Ingeniería del Software e Inteligencia Artificial.

Pública

Predoctoral grant (FPU)

2022-12 · Ministry of Science, Innovation and Universities

Financiación de investigación predoctoral

Referencia: FPU21/03837

2022-12 - Actualidad

Ayuda competitiva basada en méritos para financiar la investigación doctoral y su fase de orientación postdoctoral.

Reconocimiento

Bachelor's End-of-Program Extraordinary Award Profesor José María Troya Linero

2022-07 · Universidad de Málaga

Premio al mejor expediente académico del Grado en Ingeniería de la Salud, considerando ambas menciones.

MSc

Master's degree in Software Engineering and Artificial Intelligence

Universidad de Málaga · 2021-10 - 2022-07

9.67/10 (With Honors in 6 subjects)

Final Master Project: New advances in evolutionary machine learning for gene regulatory network inference

Evolutionary machine learning for gene regulatory network inference

Reconocimiento

Destacad@s Awards 2021

2021-11 · BBVA, Diario Sur

Reconocimiento como uno de los tres mejores expedientes académicos de la Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática de la promoción 2020/2021.

BSc

Bachelor's Degree in Health Engineering with a specialization in Bioinformatics

Universidad de Málaga · 2017-10 - 2021-07

8.89/10 (With Honors in 17 subjects)

Final Degree Project: Design of a workflow for the analysis of massive sequencing data

Massive sequencing data analysis

Experiencia

CIMES

2021-03 - 2021-06 · Málaga, Andalusia, Spain

Student Trainee

Experiencia

Student Trainee

2021-03 - 2021-06

  • Ubicación: Málaga, Andalusia, Spain
  • Tipo: Prácticas, Híbrido
Tareas (6)
  • Desarrollé un pipeline automatizado de análisis NGS para muestras tumorales en el supercomputador Picasso.
  • Programé scripts en Bash y R con GNU Parallel para procesamiento de muestras a gran escala.
  • Integré FastQC, MultiQC, Qualimap y vcftoolz compare para control de calidad y visualización.
  • Evalué distintos alineadores y detectores de variantes para reducir falsos positivos.
  • Anoté variantes usando ANNOVAR, OpenCRAVAT, MyVariant y bases de datos biomédicas.
  • Detecté alteraciones en el número de copias y fusiones génicas mediante informes unificados en R.
Certificación

Boost Your Future - Professional Development Workshop

ESESA · 2017-09

Reconocimiento

Award for the Best High School Academic Record

2017-06 · Málaga City Council, Education Department

IX Premios de Educación Ciudad de Málaga.

Certificación

Cambridge English: Preliminary (PET) - Level B1

University of Cambridge · 2015-07

  • ID de credencial: 0049218488

Proyectos

Proyectos de investigación e innovación docente

Miembro del equipo de trabajo Miembro del equipo de investigación IP / Co-IP

Docencia

Clases y supervisión

Horas de docencia

Horas de docencia por curso académico

UMA
36 h
2022/2023
56.1 h
2023/2024
60 h
2024/2025
27.9 h
2025/2026
Horas de docencia

Horas de docencia por titulación

UMA
Grado en Ingeniería de la Salud 90.8 h
Grado en Ingeniería Informática 72 h
Grado en Biología 11.2 h
Grado en Ingeniería del Software 6 h
UMA
Clase Supervisión
2023 2024 2025
Docencia universitaria

Análisis y Diseño de Algoritmos

Grado en Ingeniería Informática

2025/2026

Lenguajes y Ciencias de la Computación (LCC)

18.0 horas

Docencia universitaria

Biología de Sistemas

Grado en Ingeniería de la Salud

2025/2026

Lenguajes y Ciencias de la Computación (LCC)

9.9 horas

Tutorización de prácticas externas

Tutorización de prácticas externas extracurriculares

Grado en Bioquímica

Tutor externo de prácticas

300.0 horas

Docencia universitaria

Análisis y Diseño de Algoritmos

Grado en Ingeniería del Software

2024/2025

Lenguajes y Ciencias de la Computación (LCC)

6.0 horas

Docencia universitaria

Análisis y Diseño de Algoritmos

Grado en Ingeniería Informática

2024/2025

Lenguajes y Ciencias de la Computación (LCC)

36.0 horas

Docencia universitaria

Diseño y Explotación de Almacenes de Datos

Grado en Ingeniería Informática

2024/2025

Lenguajes y Ciencias de la Computación (LCC)

18.0 horas

Docencia universitaria

Estándares de Datos

Grado en Ingeniería de la Salud

2023/2024

Lenguajes y Ciencias de la Computación (LCC)

44.9 horas

Docencia universitaria

Informática

Grado en Biología

2023/2024

Lenguajes y Ciencias de la Computación (LCC)

11.2 horas

Docencia universitaria

Bases de Datos

Grado en Ingeniería de la Salud

2022/2023

Lenguajes y Ciencias de la Computación (LCC)

36.0 horas

Transferencia de conocimiento

Divulgación y medios

49 Total de acciones de divulgación
Artículos de divulgación científica
2
Presentaciones
2
Noticias de prensa
27
Acciones en redes sociales
17
Acciones en televisión
1

Entidades

Organizaciones

19 Organizaciones vinculadas
5 Países
7 Ciudades

France

Lille

University

Université de Lille

ULille

Estancias de investigación · 4 meses Publicaciones · 0.5 artículos

Organizaciones contenidas

Research laboratory

CRIStAL

Centre de Recherche en Informatique, Signal et Automatique de Lille

ULille > CRIStAL

Estancias de investigación · 4 meses Publicaciones · 0.25 artículos

Organizaciones contenidas

Research team

ORKAD

Operational Research, Knowledge And Data

ULille > CRIStAL > ORKAD

Estancias de investigación · 4 meses Publicaciones · 0.25 artículos
Research unit

INFINITE

Institute for Translational Research in Inflammation

ULille > INFINITE

Publicaciones · 0.25 artículos